Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AGAP1Q9UPQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AGAP1Q9UPQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AGAP1Q9UPQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AGAP1Q9UPQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AGAP1Q9UPQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms