Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRPK3Q9UPE1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK3Q9UPE1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK3Q9UPE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRPK3Q9UPE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms