Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ALKQ9UM73 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ALKQ9UM73 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ALKQ9UM73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ALKQ9UM73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ALKQ9UM73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms