Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNRF3Q9ULT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNRF3Q9ULT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNRF3Q9ULT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNRF3Q9ULT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNRF3Q9ULT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms