Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDRG4Q9ULP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDRG4Q9ULP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDRG4Q9ULP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDRG4Q9ULP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms