Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT6Q9ULM6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNOT6Q9ULM6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNOT6Q9ULM6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms