Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DENND2AQ9ULE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DENND2AQ9ULE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DENND2AQ9ULE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DENND2AQ9ULE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DENND2AQ9ULE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms