Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AMFRQ9UKV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AMFRQ9UKV5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMFRQ9UKV5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms