Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CROTQ9UKG9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CROTQ9UKG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CROTQ9UKG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CROTQ9UKG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms