Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCNL1Q9UK58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNL1Q9UK58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCNL1Q9UK58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCNL1Q9UK58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNL1Q9UK58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCNL1Q9UK58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms