Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF223Q9UK11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF223Q9UK11 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF223Q9UK11 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF223Q9UK11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms