Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C3orf18Q9UK00 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C3orf18Q9UK00 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C3orf18Q9UK00 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf18Q9UK00 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms