Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH22Q9UJ99 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH22Q9UJ99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH22Q9UJ99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH22Q9UJ99 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1227.7 ms