Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PUF60Q9UHX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PUF60Q9UHX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PUF60Q9UHX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PUF60Q9UHX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUF60Q9UHX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUF60Q9UHX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms