Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPN3Q9UHW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPN3Q9UHW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPN3Q9UHW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms