Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EBF1Q9UH73 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EBF1Q9UH73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBF1Q9UH73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EBF1Q9UH73 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF1Q9UH73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms