Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DKK2Q9UBU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK2Q9UBU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms