Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MGAT4CQ9UBM8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MGAT4CQ9UBM8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MGAT4CQ9UBM8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MGAT4CQ9UBM8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MGAT4CQ9UBM8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms