Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF7Q9UBF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF7Q9UBF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF7Q9UBF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF7Q9UBF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms