Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNMT3BQ9UBC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNMT3BQ9UBC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNMT3BQ9UBC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms