Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFAF4Q9P032 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFAF4Q9P032 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF4Q9P032 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF4Q9P032 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms