Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRN3Q9NYV6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRN3Q9NYV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRN3Q9NYV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRN3Q9NYV6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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