Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLN6Q9NWW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLN6Q9NWW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN6Q9NWW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms