Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OXSMQ9NWU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OXSMQ9NWU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OXSMQ9NWU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms