Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASF1BQ9NVP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASF1BQ9NVP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASF1BQ9NVP2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms