Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPTLC3Q9NUV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTLC3Q9NUV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTLC3Q9NUV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms