Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMBRD1Q9NUN5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMBRD1Q9NUN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMBRD1Q9NUN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMBRD1Q9NUN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMBRD1Q9NUN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms