Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GINM1Q9NU53 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GINM1Q9NU53 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GINM1Q9NU53 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GINM1Q9NU53 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GINM1Q9NU53 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GINM1Q9NU53 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms