Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATG3Q9NT62 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATG3Q9NT62 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG3Q9NT62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG3Q9NT62 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG3Q9NT62 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms