Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOMER2Q9NSB8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOMER2Q9NSB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOMER2Q9NSB8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOMER2Q9NSB8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOMER2Q9NSB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms