Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRN4Q9NRL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRN4Q9NRL3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRN4Q9NRL3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
STRN4Q9NRL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
STRN4Q9NRL3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRN4Q9NRL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRN4Q9NRL3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRN4Q9NRL3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRN4Q9NRL3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRN4Q9NRL3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRN4Q9NRL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms