Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTBN5Q9NRC6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPTBN5Q9NRC6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms