Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf4Q9NR00 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8orf4Q9NR00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf4Q9NR00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf4Q9NR00 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms