Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPDC1Q9NQX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPDC1Q9NQX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPDC1Q9NQX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPDC1Q9NQX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms