Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZDHHC4Q9NPG8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZDHHC4Q9NPG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZDHHC4Q9NPG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZDHHC4Q9NPG8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZDHHC4Q9NPG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZDHHC4Q9NPG8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZDHHC4Q9NPG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZDHHC4Q9NPG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms