Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBN1Q9NPG3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBN1Q9NPG3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBN1Q9NPG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
UBN1Q9NPG3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBN1Q9NPG3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms