Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRM3Q9NNZ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRM3Q9NNZ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRM3Q9NNZ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRM3Q9NNZ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms