Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PREBQ9HCU5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PREBQ9HCU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms