Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4F12Q9HCS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4F12Q9HCS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4F12Q9HCS2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4F12Q9HCS2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms