Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR35Q9HC97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR35Q9HC97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR35Q9HC97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR35Q9HC97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPR35Q9HC97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR35Q9HC97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR35Q9HC97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR35Q9HC97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms