Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC4Q9HBW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4Q9HBW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC4Q9HBW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC4Q9HBW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms