Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLK4Q9HAZ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLK4Q9HAZ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK4Q9HAZ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms