Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM38AQ9H6F2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM38AQ9H6F2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM38AQ9H6F2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms