Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HIPK3Q9H422 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIPK3Q9H422 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIPK3Q9H422 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIPK3Q9H422 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIPK3Q9H422 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms