Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDCL3Q9H2J4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDCL3Q9H2J4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDCL3Q9H2J4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDCL3Q9H2J4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL3Q9H2J4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms