Protein–RNA interactions for Protein: Q9H082

RAB33B, Ras-related protein Rab-33B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33BQ9H082 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB33BQ9H082 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB33BQ9H082 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB33BQ9H082 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB33BQ9H082 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms