Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRY4Q9C004 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRY4Q9C004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRY4Q9C004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPRY4Q9C004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPRY4Q9C004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms