Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC8Q9BY41 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC8Q9BY41 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC8Q9BY41 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC8Q9BY41 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.4 ms