Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNM1Q9BWG6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNM1Q9BWG6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCNM1Q9BWG6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms