Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PBDC1Q9BVG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PBDC1Q9BVG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PBDC1Q9BVG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms